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Los eventos de Metal Gear Rising: Revengeance se desarrollan cuatro años después de los eventos de Metal Gear Solid 4: Guns of the Patriots.

Los Patriots, una poderosa organización en la sombra que dirige la economía de la guerra mundial, han sido destruidos y las Compañías Militares Privadas (PMC) se han dividido en numerosas facciones. Con la eliminación de la tecnología de nanomáquinas controlada por Patriot que se usa para regular las habilidades de los soldados, los PMC recurren a la tecnología cyborg avanzada, creando soldados sobrehumanos duraderos.

Controlas a Raiden, un ex niño soldado convertido en un cyborg que ahora trabaja para PMC Maverick Securities. Raiden cuenta con el apoyo de sus colegas de Maverick, el puntero ruso Boris Popov, el asesor militar Kevin Washington, la especialista en informática Courtney Collins y el experto en cibernética Wilhelm "Doktor" Voight. Regresando de Metal Gear Solid 4: Guns of the Patriots está Sunny, un miembro de la compañía Solis que es amigo de Raiden.