Yu-Gi-Oh! Duel Generations non sarà più disponibile in modalità online dopo il 30 settembre 2020.
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I giocatori registrati che sono collegati a internet possono partecipare alla sfida settimanale. Questa modalità è accessibile dalla schermata del menu principale toccando l'icona del calendario in alto a sinistra.
La sfida è quella di battere i cinque Duellanti qualificati especialmenti preparati per l'evento di ogni settimana. Battere uno qualsiasi dei Duellanti premia una scheda e Punti di Duello. Battere tutti li guadagna cinque bonus, la stessa quantità che si otterrebbe in un Booster Bonus!