Ce jeu rétro utilise la fonction de sauvegarde automatique et enregistre à certains points de contrôle (ascenseurs par exemple). Même si vous pouvez sauvegarder le jeu à tout moment via le menu de pause, vous ne serez pas en mesure de commencer à jouer à partir de ce point depuis le fichier enregistré : vos données sauvegardées ne vous permettrons que de démarrer à partir du dernier point de sauvegarde.
Vous serez en mesure d'accéder à vos données sauvegardées à partir de l'intérieur du menu principal de Metal Gear ("Charger Jeu"), et non à l'intérieur du menu de Metal Gear Solid 3: Snake Eater.
