Metal Gear Solid V: Ground Zeroes funciona como un prólogo de Metal Gear Solid V: The Phantom Pain y tiene lugar un año después de los acontecimientos de Metal Gear Solid: Peace Walker. Asumiendo el control del legendario Snake, también conocido como Big Boss, los jugadores se encargan de la infiltración en el Campamento Omega, donde se encuentran Paz y Chico. Los rehenes contienen información clave sobre Snake y su privada organización militar, por lo que Snake y su aliado Kaz Miller deben evitar que se divulgue dicha información. Metal Gear Solid V: Ground Zeroes se centra en el rescate y las posteriores consecuencias que conducen al inicio de Metal Gear Solid V: The Phantom Pain. Metal Gear Solid V: Ground Zeroes actúa además como un puente entre anteriores títulos de Metal Gear Solid, facilitando así a los jugadores la entrada al famoso mundo de Metal Gear Solid V.