Die Kampagne ist ein Free to Play-Spiel und als Einzelspieler-Modus für Duel Generation Spieler verfügbar. Es ist abrufbar durch klicken der Kampagne-Schaltfläche im Hauptmenu vom Spiel. Die Kampagne beinhaltet 80 Charakter von der Fernseherserie Yu-Gi-Oh! zum üben und verdienen von Duellpunkten. Jedes mal, wenn du einen von den Charakteren besiegst, wird ein neuer Gegner entsperrt, damit du gegen ihn antreten kannst.
Jeder Charakter hat ein Anfängerdeck und ein Expertendeck. In den ersten 3 Partien gegen irgendeinen Gegner, wird dieser das Anfängerdeck verwenden. Wenn du diesen besiegst, erhälst du Duellpunkte, Bonuskarten und eine neue Deckkombination. Die weiteren Partien spielst du gegen das Experten-Deck vom Gegner, welche dir die gleichen Errungenschaften verleihen. Nachdem du einen Charakter 6 mal besiegt hast, entsperrst du deren Abbildung, welche du als persönlichen Avatar fürs Spiel verwenden kannst.